Protocol（研究方案）论文是一类描述研究方法的文章。近年来，越来越多的高分期刊考虑接受研究设计类的文章，发表protocol论文成为一些医生晋升职称的救命策略。
据web of science统计，Protocol论文发文数量近10年来一直在快速增长，2021年发表43,872篇，与2012年相比约增长2.16倍；该类型论文的热度值达到了70。
其中2021年发文最多的国家依次为：美国、中国、英国。中国学者发表了7469篇，占17%。发表protocol相关研究最多的六个SCI医学杂志分别是Medicine, BMJ Open, Trials, Syst Rev, Int J Environ Res Public Health，和BMC Public Healthy。参考下图，您可以在投稿选择期刊时更有针对性。需要注意的是，Medicine已经被中科院列为高危期刊，所以投稿时尽可能避开。比较推荐的是BMJ Open和Trials这两个期刊，对于临床试验特别友好；meta分析的protocol论文则可以投Syst Rev；公共卫生领域的研究设计则可以投Int J Environ Res Public Health或者BMC Public Healthy。IF=-1的标记意味着该期刊尽管被Medline数据库收录，但不是SCI收录期刊；部分是掠夺性期刊，投稿时要特别小心。Protocol论文关注的重点疾病包括糖尿病，针灸，抑郁，精神卫生，中风等；进一步往下看，可以看到几乎涉及所有科室的疾病。
这篇IF=15.534的高分protocol文章发表于《European Journal of Heart Failure》。作为一种降糖药的它可以明显改善心衰患者的预后，这种获益与患者是否合并糖尿病无关，令人惊呼的结果离不开严谨的protocol套路研究设计。
①Bio-protocol：发表经过同行评审的优质实验方案。https://cn.bio-protocol.org/cn/default.aspx
②Springer Nature Experiments：包含生物医学领域的60 000+实验室可重复Protocol。https://experiments.springernature.com/③Nature Protocol Exchange：由Nature Protocols赞助的Protocol开放存取库，是一个用于共享科学研究协议的开放存储库。https://protocolexchange.researchsquare.com④Protocols.io：一个共享的Protocol平台，其中的每一篇Protocol都是动态、交互式的。https://www.protocols.io/⑤Cold Spring Harbor Protocols：Protocol分类融合了研究领域和学科，里面的大部分文章都给出了step-by-step的实验操作流程。http://cshprotocols.cshlp.org/⑥Morimoto laboratory，专注于热休克反应的调节和分子伴侣的功能http://groups.molbiosci.northwestern.edu/morimoto/⑦JoVE：不仅提供step-by-step的实验方案，而且提供实验流程的视频讲解，使得研究者能够直观的看到实验的复杂细节。
可以通过下载附件来查看。一些文献的研究方案就是以附件形式附录在后，仔细阅读学习后，对整个研究的了解会更深入，同时更能体会到高分SCI文章在研究实施时的全面和细节上的完善。Trials是临床试验发表protocol最有名的杂志，因为接受接受文章种类多样，包括Study Protocol，因此很多临床研究者会在上面发表自己的Study Protocol。
参考循证医学金字塔，处在证据级别顶端的是系统综述及随机临床试验的结果，而观察性及病例对照研究则略逊一筹。因此，研究类型的选择也决定了文章研究水平的定位。与所有论文一样，protocol论文的设计也需要有创新性和严谨性两个基本要素。而在具体实施过程中，study protocol则要求更为严格，包括：
研究方案是后续的临床试验的基础；
研究设计规范；
提供所在机构的伦理批准和临床试验注册信息；
按照特定格式（SPIRIT）撰写。
在发表 Protocol 的时候，临床试验注册是必不可少的环节，也是发表高质量 Article 的保证。这里介绍两个免费的注册平台：作者可以向自己所在医院的伦理委员会索要需要提交的材料清单，包括研究方案的具体要求。把这个写好，中文Protocol基本就出来了。另外，上伦理会时还需要提供一些研究者的资料信息。
